置了枢密院，成为了正式的军事机构。宋代，继承了五代制度，枢密院是全国最高军务机构，和中书门下并称“二府”。
唐朝后期，北方经济破坏，财政收入不足。于是唐朝派遣转运使在江南地区经营财政，并将地方的粮食、钱财运输到中央；同时，推行盐铁专卖，增加财政收入，而管理财政的官员就是盐铁使。
因为国家财政的依赖很大，转运使和盐铁使得权力就不断提高。到了后来，就干脆将管理户口的户部、管理盐铁的转运使、管理财政支出的度支合并为一个机构，并称三司，其长官为三司使，总览天下财政。而转运使则是三司在地方的机构。
如此，北宋初期的机构也就分为了中书门下、枢密院、三司，合称“二府三司”。二府三司体制形成后，中书门下的兵权、财权都已经被剥离，再一次实现了分权。
另外，北宋还在平章政事之外另外设置参知政事作为副宰相，以分割宰相行政权。其他机构内部也同样分权严重，如三司内部时而就废除三司使，让盐铁、户部、度支相互牵制；枢密院内有枢密使和枢密副使等相互牵制。比起三省六部制来，二府三司的分权现象更加细致。
然而，严重的分权也使得行政效率更加低下。同时，机构冗杂，官员过多，给国家带来了严重的财政负担。
在宋神宗时期，精兵简政成为了改革的一大政策而精兵简政的一个重要内容就是要裁汰官员，减少机构。元丰年间，宋神宗恢复了三省六部实权，如将三司并入了户部，剥夺了枢密院的兵权。如此，三省六部制又重新复活了，并且一直影响到了明清。
南宋时期，继续在元丰改制的基础上进行改革。为了进一步提高行政效率，南宋又再次让三省合署办公。1130年，宰相开始兼任枢密使，到1205年，“以宰臣兼使，遂为永制”，于是宰相就同时掌握行政、财政和兵权了。南宋的精兵简政，使得机构减少了一半以上，大大减轻了国家财政负担，提高了行政效率。
不过，带来的弊端同样明显，南宋就开始出现了北宋未曾出现的权臣，例如贾似道。
唐宋两代，在中央制度上不断变革，在集权和分权之间不断徘徊，最终还是走了一个大大的轮回。即便如此，唐宋的机构变迁对后世还是产生了巨大的影响。
虽然三省制最终在明朝被废除了，但是六部最终延续到了清朝，成为了具体的行政机构。在中国古代，权力集中于皇帝是历史大趋势，但是行政效率却是一个问题。例如，明朝将君主
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