与大炊御门家也受到贬斥，今出川晴季晋升正二位権大纳言，其嫡长子年仅五岁变过继花山院家，元服改名为花山院忠熙。
大炊御门家则被亲幕府的西园寺公朝次子，大炊御门经孝继承家门，正二位権大纳言德大寺実维无嗣，由早年客居关东的德大寺公教之子，德大寺実久继承家门并迅速晋升従四位下参议、左近卫権中将，这样一来清华家与摄关家一样被亲幕府派的公卿彻底掌握。
通过养女联姻新天皇，变向保证天皇的皇位合法性，自然的也要承认新天皇的改元年号，在年初新天皇登基改元的年号是元龟，于是在年底的朝会上就商量着把这一年是所有历法全部改为元龟元年，此时这纷乱的一年也渐渐走到末尾。
元龟二年（1570年）正月的朝会，大概是近几十年规模正庞大的一次，源义时以内大臣的身份与关白左大臣近卫前久、右大臣中院通为主持朝会，在大朝会上除去一些礼仪性质的活动以外，还有最重要的一个议题，满朝公卿的御料所配给。
原本整个天下都是朝廷的，天皇家的庄园几千座，摄关公卿的庄园也有几千座，结果被武士出身的地头们篡夺地方的实权，建立一套别出朝廷之外的武家幕府体系，承久之乱天皇家的庄园被剥夺的寥寥无几，到应仁之乱更是连所剩无几的皇家庄园也被地方国人霸占，这个个时候朝廷就非常希望新将军能站出来给他们恢复那些庄园的征税权。
关系到吃饱肚子的问题就没有小事，公卿么梦寐以求的无非是吃的好住的好，从这些年源义时与朝廷的愉快合作来看，这位新将军还是非常好说话的一位武士，所以他们才敢大着胆子提出自己的一些殷切希望。包括正亲町上皇、坐朝的新天皇。以及关白近卫前久、舅舅中院通为在内的所有人都在关心这个问题。
源义时看他们伸长脖子眼巴巴的表情很有意思。轻笑一声便说道：“余亦知禁中、公卿御料地所入不多，前度战乱频发致使朝廷困窘公卿受难，余亦有意扶住朝廷以保社稷，只是考虑到远国庄园征税不易，且因战乱影响土民流离失所，下向远国坐镇地方亦难征几分税赋，如若碰到奸猾之辈与诸君纠缠周旋闹出诉讼，难道还要我等堂堂公卿。放下面子闹诉讼否？这有失体面啊！”
公卿们窘的抬不起头很是尴尬，诸家公卿哪个家族没有家督亲自下向督促税赋经历，寻常闹出点诉讼折腾个十年八年不算奇怪，比如二十年前，山科言继就为他家的御料所税收权力，几次三番的给前幕府将军足利义晴送礼。
再比如源义
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